Dado que este estudio es sólo el diagnóstico preliminar de una zona bastante grande y compleja, y que fue realizado en poco tiempo, no ha sido posible identificar con precisión la zona, ni tampoco sus unidades ambientales e interacciones en forma especifica. Por ello, se ha hecho una introducción de métodos y directrices para enmarcar el nivel y alcances de los estudios de la siguiente fase. La metodología usada incluye la determinación y descripción de las "unidades ambientales" de la región colombiana y de la región ecuatoriana con el fin de analizar los principales conflictos ambientales.
A través de una rápida prospección de campo, y discusiones con personas que están familiarizadas con la zona y consultando informes y publicaciones existentes, se logró obtener los datos preliminares. Estos datos fueron analizados con el uso de varias matrices que indican, en forma general las interacciones importantes en la zona.