Se ha denominado zona media al sector de la cuenca a la altura de El Real. El río Tuira nace en los "altos de Quia", en la frontera con Colombia, y desemboca en el Golfo de San Miguel frente a La Palma. Su parte media corresponde a las inmediaciones de El Real.
En esta zona existe un complejo de ríos constituido principalmente por el Tuira, que pasa por El Real y Pinogana y recibe como afluente al Chucunaque, uno de los más importantes de Panamá. A la altura de Yaviza el Chucunaque recibe las aguas del río Chico.
Esta zona tiene importancia debido a los recursos de agua, aparte de la presencia de la población urbana en los centros poblados de El Real, Yaviza y Pinogana. Asimismo, el trazado de la Carretera Panamericana pasa muy cerca de Yaviza, lo que permitirá a la zona su expedita comunicación con la ciudad de Panamá, que queda a unos 260 kilómetros.
i. Flujos
Las informaciones preliminares indican que los flujos medios mínimos de los ríos principales de la zona serían los siguientes:
- Chucunaque, antes de Yaviza 15 m3/segundo- Chico antes de Yaviza 5 m3/segundo
- Chucunaque, después de Yaviza 20 m3/segundo
- Tuira, antes de la confluencia con el Chucunaque 10 m3/segundo
- Tuira, después de la confluencia con el Chucunaque 30 m3/segundo
El promedio de los caudales máximos en invierno pueden representar entre 10 y 15 veces el flujo antes indicado. Las diferencias de caudal producen crecidas de hasta 8 a 10 metros frente a Yaviza.
ii. Calidad
Las apreciaciones visuales indican que en las lagunas que no forman el curso principal de los ríos, las aguas son en general ácidas, de altos valores en CO2 y bajo tenor de O2. La razón de estas características es la descomposición de materia orgánica debido a la presencia de abundante flora.
Las aguas ácidas soportan poblaciones menores de peces que las alcalinas y dificultan la vida de éstos cuando los valores de O2 bajan de ciertos límites.
No hay información sobre la calidad de las aguas de los ríos.